Para responder a un mensaje de WhatsApp Plus tienes básicamente que escribir tu propio mensaje en la conversación. Cuando recibes un mensaje, hay dos formas de acceder hasta la conversación:
Acceder a la aplicación, pulsando sobre su icono en el escritorio o en el menú de aplicaciones en función de cómo hayas configurado ese acceso directo. Una vez dentro verás las conversaciones con nuevos mensajes en lo alto del listado.

Pulsar sobre la notificación que te aparecerá en pantalla, ya que actúa como un acceso directo hasta la misma conversación. Eso siempre y cuando tengas activadas las notificaciones para WhatsApp Plus en los ajustes del sistema operativo.

Una vez estás ante la conversación, basta con que pulses la caja de texto inferior de la pantalla con el texto Type a message para abrir el teclado. Escribe tu mensaje y pulsa el botón de enviar que hay a la derecha de esa caja de texto, un icono con forma de avión de papel.

Contestar un mensaje dentro de una conversación
Cosa distinta es que quieras responder directamente un determinado mensaje en una conversación, ya sea de grupo o individual. En este caso lo que se hace es replicar el comentario de otra persona, mostrando tanto el texto original como nuestra respuesta.
En WhatsApp Plus puedes hacer esto de una forma muy sencilla, igual que en la app original: deslizando el mensaje en cuestión hacia la derecha. Eso abrirá automáticamente el teclado para que escribas tu respuesta, poniendo primero el mensaje original al que te refieres. También puedes responder a tus propios mensajes haciendo el mismo movimiento.

Si este truco no te funciona, basta con mantener pulsado el mensaje a responder durante unos segundos. En ese momento nos aparecerá en la parte superior una barra de herramientas con iconos, entre los que está la opción Reply y podremos hacer exactamente lo mismo: escribir nuestro mensaje y que se muestre después del que estamos usando como referencia.

Como puedes comprobar hay muchas formas de responder un mensaje en el MOD, usa la que te resulte más cómoda y funcional.